अम्लीय रंगों में हाइड्रॉक्सिल, कार्बोक्सिल और सल्फोन समूह जैसे ऑक्सोक्रोमैटिक समूह होते हैं जो समाधान में नकारात्मक रूप से चार्ज होते हैं। इस वर्णक और Na, K, और Ca आयनों से बना नमक घोल में क्षारीय होता है। यह धनावेशित कोशिकाओं के महत्वपूर्ण घटकों के साथ जुड़ जाता है, या साइटोप्लाज्म, लाल रक्त कोशिकाओं, मांसपेशी फाइबर आदि को दागने के लिए अंतरकोशिकीय स्थान में घुसपैठ करता है।
