अधिकांश कोशिकाएं बहुत छोटी हैं, मानव दृष्टि की सीमा से परे। कोशिकाओं का निरीक्षण करने के लिए एक माइक्रोस्कोप का उपयोग किया जाना चाहिए। हालांकि, जब तक कोशिकाओं के उद्देश्य अस्तित्व को मान्यता नहीं दी जाती है, तब तक यह जानना असंभव है कि माइक्रोस्कोप के तहत देखी जाने वाली वस्तुएं कोशिकाएं हैं। इसलिए 1677 में, जब ए। वैन लीउवेनहोके ने एक जानवर जीजी का उद्धरण देखा; एक साधारण माइक्रोस्कोप के साथ, उन्होंने 39 को ज्ञात नहीं किया कि यह एक कोशिका थी। सेल शब्द (लैटिन सेल से व्युत्पन्न, जिसका मूल अर्थ शून्य है, सेल) का नाम आर। हुकर के नाम पर रखा गया था कि कॉर्क में 1667 में कॉर्क सेक्शन का अवलोकन करते समय छोटी कोशिकाएं थीं। वास्तव में, ये कोशिकाएं जीवित संरचना नहीं हैं, लेकिन इससे बच जाती हैं। सेल दीवारों द्वारा गठित, लेकिन सेल शब्द का उपयोग इस कारण से किया गया है। कोशिका विज्ञान के ज्ञानोदय काल में, हालांकि कई छोटी-छोटी वस्तुएं जैसे कि बैक्टीरिया और सिलिलेट्स भी एक साधारण सूक्ष्मदर्शी से देखे जाते हैं, मुख्य उद्देश्य कुछ विकास संबंधी घटनाओं का निरीक्षण करना है, जैसे कि तितलियों के कायापलट, शुक्राणु और अंडे की संरचना। उस समय माइक्रोस्कोप की सीमाओं के कारण, टिप्पणियों की अशुद्धि, और धार्मिक विश्वासों की अड़चन, इन टिप्पणियों ने वास्तव में पूर्व-स्थापना सिद्धांत की हठधर्मिता का समर्थन किया था। कुछ लोग दावा करते हैं कि उन्होंने विशिष्ट और सूक्ष्म जीजी उद्धरण देखा है; छोटे पुरुष जीजी उद्धरण; शुक्राणु में, और विश्वास है कि वे भविष्य के व्यक्तियों में विकसित होंगे --- आवश्यकताओं; दूसरों का मानना है कि जीजी उद्धरण; छोटे पुरुष जीजी उद्धरण; अंडे में मौजूद है --- अंडे देने वाले। आर। हुकर के आधार पर कोशिकाओं की आगे की समझ से लोगों को बाधित करते हुए, पूर्वधारणाओं का प्रभाव 100 से अधिक वर्षों तक रहा। यह 1827 तक नहीं था कि एम.एम. बेल ने स्तनधारी अंडों की खोज की कि वे स्वयं कोशिकाओं का ध्यानपूर्वक निरीक्षण करने लगे। इससे पहले और बाद में विकसित किया गया अवर्णी वस्तुनिष्ठ लेंस, नाभिक को रंगने के लिए रंगों के रूप में कारमाइन और हेमटोक्सिलिन की शुरूआत, और माइक्रोटेम और स्लाइसिंग तकनीक के स्टार्ट-अप ने कोशिकाओं के अधिक विस्तृत अवलोकन के लिए अनुकूल परिस्थितियों का निर्माण किया है।
